Për të operuar në mënyrë të sigurt gjeneratorët me gaz natyral dhe për t'i mbrojtur pjesët nga dëmtimi, pastërtia e karburantit është e rëndësishme. Gazin që furnizohet duhet të përmbajë një numër minimal të papastërtive, dhe ndotësit duhet të plotësojnë disa udhëzime të caktuara, veçanërisht në lidhje me komponimet e sulfurit, lagështinë dhe grimcat. Përqendrimi i sulfurit, për shembull, duhet të mbahet nën 20 mg/m³ për të shmangur korrozionin e pjesëve të motorrit dhe bllokimin e injektorëve të karburantit. Nëse ka shumë lagështi, sistemi i karburantit mund të bllokohet për shkak të formimit të akullit gjatë kohës së ftohtë, gjë që do të kufizonte rrjedhën e karburantit dhe do të dëmtoni prodhimin e energjisë. Pluhuri dhe grimcat e ndotura mund të gërvishtin pjesët e brendshme të motorrit, gjë që do të zvogëlojë jetëgjatësinë e gjeneratorit dhe do të rrisë nevojën për mirëmbajtje. Nëse plotësohen standardet e pastërtisë, gjeneratori do të funksionojë në mënyrë efikase dhe dështimi i çdo pjese do të jetë i parashikueshëm.

Shtypja e mjaftueshme e karburantit dhe shkalla e rrjedhjes janë të domosdoshme për gjeneratorët e gazit natyror që të funksionojnë në mënyrë të besueshme. Madhësitë dhe llojet e ndryshme të gjeneratorëve do të kenë kërkesa specifike të ndryshme për shtypjen e gazit. Megjithatë, shumica e gjeneratorëve kanë nevojë për shtypje gazesh në diapazonin 3,5 psi deri në 7 psi në pikat e hyrjes. Nëse shtypja e gazit është shumë e ulët, gjeneratori nuk do të marrë mjaftueshëm karburant për t'i plotësuar kërkesat e energjisë dhe do të humbasë fuqinë ose do të fiket plotësisht. Nëse shtypja e gazit është shumë e lartë, do të shkaktojë shpërthimin e regulatorit të karburantit dhe pjesëve tjera mbrojtëse. Po ashtu, shkalla e furnizimit me karburant duhet të jetë e barabartë me konsumin maksimal të karburantit të gjeneratorit. Për shembull, gjatë punës me ngarkesë të plotë, gjeneratorët 100 kW me gaz natyror do të kërkojnë shkallë rrjedhje prej 10 kubik fut në minutë (cfm). Për performancë të besueshme të gjeneratorit, furnizimi me gaz duhet të ruajë shkallë të mjaftueshme rrjedhjeje dhe shtypje.
Çdo lloj perzierje gazi natyror perdor menyra te ndryshme djegjeje, perberja e gazit te natyres duhet te jete ne nivelin e duhur qe gjeneratori te kete nje djegje efikase dhe te kufizuar emetime. Gazi natyror duhet te kete nje minimum 85% metan per nje perzierje te efiket si dhe per kurren kryesore, qe do te thote se duhet te digjet pastaj dhe me efikasitet per te arritur emetimet e rrepta te djegies. Etani dhe propani mund te digjen ne karburant por duhet te jene ne përqindje te vogla, zakonisht me pak se 10%, shume do te nderroje karburantet djegese. Nëse djegia e karburanteve djegese eshte e paplotë, do te rrise emetimet e djegies NOx dhe CO dhe do te zvogeloje efikasitetin e djegies se gjeneratorit. Gjithashtu, duhet te kete djegie karburanti ne gazin e natyres.
Për të ruajtur besueshmërinë afatgjatë të sistemit të karburantit të një gjeneratori. Gazin e natyrshëm duhet të jetë i përputhshëm me materiale dhe pjesët e përdorura në sistem. Gypat, tubat dhe pllakat, si dhe pjesët e tjera të sistemit të karburantit, janë bërë prej çeliku inox, bakri ose një polimer special. Gazin e natyrshëm nuk është korroziv, por ndotësit në gaz, si sulfuri i hidrogjenit, mund të korrodin hekurin dhe të formojnë komponime korrozive. Kjo korrozion mund të shkaktojë një rrjedhje të rrezikshme dhe të ndërprerë funksionimin e gjeneratorit, pasi gypat e dobët mund të bëhen të rrezikshëm dhe të rrjeden. Antikarburantet që tretësit ose vajrat mund të shpërndajnë pllakat dhe tubat e sistemit të karburantit. Pjesët e gjeneratorit përmirësojnë jetëgjatësinë e sistemit të karburantit dhe kursen para për mirëmbajtjen.
Përdorimi i një gjeneratori me gaz natyror do të thotë që duhet të përdorni gjithmonë standarde të sigurisë dhe përputhshmërisë me gazin. Furnizimi me gaz duhet të plotësojë standardet e sigurisë në nivel lokal dhe ndërkombëtar. Standardet ndërkombëtare të Shoqatës Kombëtare Amerikane për Mbrojtje nga Zjarri (NFPA) dhe të Organizatës Ndërkombëtare për Standardizim (ISO) përshkruajnë depozitimin, transportin dhe furnizimin e sigurt të gazit tek gjeneratori, dhe sistemet e karburantit të gazit të gjeneratorit duhet të jenë të sigurta nga rrjedhja e gazit dhe mundësia e shpërthimit. Për shembull, tubacionet e gazit duhet të izolohen si duhet, të testohen rregullisht nënçngarkesë dhe të kenë valve mbytjeje të shpejtë në vende strategjike për të ndaluar rrjedhën e gazit në rast urgjencie. Gjeneratori duhet të plotësojë ligjet vendase të mjedisit për emisionet e tij të NOx, CO dhe të grimcave të ngurta. Standardet e sigurisë dhe përputhshmërisë që përdoren me karburantin e mbrojnë njerëzit dhe pronën, dhe për autoritetet e zbatimit, e bëjnë gjeneratorin operativ ligjërisht në vendin e furnizimit me gaz.