Loodusliku gaasi generaatorite ohutuks käitamiseks ja nende osade kahjustumisest kaitsemiseks on kütuse puhtus oluline. Tootavas gaasis peaks olema minimaalne segunete arv ja saasteained peaksid vastama teatud nõuetele, eriti vajadusel väävlisisalduse, niiskuse ja tahkiste suhtes. Näiteks tuleb väävli kontsentratsioon hoida alla 20 mg/m³, et vältida mootori osade korrosiooni ja kütuseprellide ummistumist. Kui niiskust on liiga palju, võib külmas ilmas jäätekke tõttu kütusesüsteem ummikuda, mis piirab kütusevoolu ja halvendab võimsust. Tolmu- ja mustuseosakesed võivad kriimustada mootori sisemisi osi, mis vähendab generaatori eluiga ja suurendab hooldusvajadust. Kui puhtusnõuded täidetakse, toimib generaator efektiivselt ja mistahes osa riknenemine on ennustatav.

Piisav kütuse rõhk ja voolukiirus on olulised, et maagaasigeneraatorid töötaksid usaldusväärselt. Erineva suuruse ja tüübiga generaatoritel on erinevad konkreetse gaasi rõhu nõuded. Enamikel generaatoritel on siiski gaasi rõhu nõue 3,5 psi kuni 7 psi sisselaskepunktides. Kui gaasi rõhk on liiga madal, ei saa generaator piisavalt kütust võimsuse nõuete täitmiseks ja see kaotab toite või lülitub täielikult välja. Kui gaasi rõhk on liiga kõrge, põhjustab see kütuse regulaatori ja teiste kaitsekomponentide purunemise. Samuti peab tarnitud kütuse voolukiirus võrduma generaatori maksimaalse kütusekulu võrra. Näiteks nõuavad 100 kW maagaasigeneraatorid täislöögi ajal voolukiirust 10 kuupjalgu minutis (cfm). Usaldusväärse generaatori jõudluse tagamiseks peaks gaasivarude süsteem säilitama piisava voolukiiruse ja rõhu.
Iga tüüpi maagaasi segu kasutab erinevaid põlemisviise, maagaasi koostis peab vastama generaatori tõhusale põlemisele ja heitmete piiramisele. Tõhusa kütusesegu saavutamiseks peab maagaas sisaldama vähemalt 85% metaani, mis on peamine kütus, seega peab see põlema puhtalt ja tõhusalt, et vastata rangele põlemisheitmete nõudele. Etan ja propaan võivad kütuses põleda, kuid nende osakaal peab olema väike, enamasti alla 10%, liiga suur kogus muudab põlevate kütuste käitumist. Kui kütuse põlemine on ebapiisav, suurenevad NOx-i ja CO heitmed ning väheneb generaatori põlemistõhusus. Lisaks peab maagaasis toimuma kütuse põlemine.
Generaatori küttesüsteemi pikaajalise usaldusväärsuse tagamiseks peab maagaas olema ühilduv küttesüsteemis kasutatavate materjalide ja komponentidega. Torud, õhutised ja tihendid ning muud küttesüsteemi komponendid on valmistatud roostevabast terasest, messingist või erilisest polümeerist. Maagaas ei korrodeerita, kuid gaasis olevad lisandid, nagu väävelvesinik, võivad korrodeerida rauda ja moodustada korrosiooni tekitavaid ühendeid. See korrosioon võib põhjustada ohtliku lekke ja häirida generaatori tööd, kuna nõrgenenud torud võivad muutuda ohtlikuks ja lekkima hakata. Antifuellid, mille lahustid või õlid võivad lahustada küttesüsteemi tihendeid ja õhutisi. Generaatori komponendid parandavad küttesüsteemi eluea ja hoolduskulude vähendamist.
Loodusgasi generaatori kasutamine tähendab, et peate alati järgima gaasiga seotud ohutus- ja vastavusnõudeid. Gaasivarustus peab vastama nii kohalikele kui ka rahvusvahelistele ohutusstandarditele. Ameerika Ühendriikide Rahvatulekaitse Assotsiatsiooni ja Rahvusvahelise Standardimise Organisatsiooni (ISO) rahvusvahelised standardid reguleerivad ohutut gaasi hoidmist, transportimist ja tarnimist generaatorile ning generaatori gaasikütusesüsteemid peavad olema turvalised lekkimise ja plahvatusohtlikkuse suhteen. Näiteks peavad gaasitorustikud olema korralikult isoleeritud, regulaarselt rõhukatsetatud ja neil peab olema kiiret sulgemisventiile strateegilistes kohtades, et hädavajadusel gaasivoolu peatada. Generaator peab vastama kohalikele keskkonnaseadustele lämmoksiidide (NOx), süsinikmonooksiidi (CO) ja tahkiste heitmete osas. Kütusega seotud ohutus- ja vastavusnõuded kaitsevad inimesi ja vara ning võimaldavad jõustamisorganitel lubada generaatori seaduslikuks kasutamiseks gaasivarustuse kohas.